最強の力を持つ “一方通行（アクセラレータ）” に当麻・美琴が共闘！学園都市で行われる二万体もの美琴のクローン 『妹達（シスターズ）』 を殺害させる 「絶対能力進化（レベル6シフト）」 計画。その実験を止めるため、美琴は最強の能力者である 『一方通行（アクセラレータ）』 に挑もうとする。だが、そこへ上条当麻が現れ……。 最強と最弱の男が激突！